Phylogenetic Trees Made Easy

 

En grunnleggende web

Et fylogenetisk tre begynner med en prøvegruppering av en bestemt art i en bestemt geografisk plassering. Tenk deg i en skog på en varm vårdag under et stort tre. Du legger merke til en gruppe av biller som kryper opp i en nærliggende gren. Tenk på fire av disse billene, representert ved å tegne fire biller i en horisontal rad på et ark papir. Hver av de fire biller har to foreldrebagler, representert av to linjer som strekker seg nedover til hvilke to foreldrebagler er avbildet. Dette mønsteret fortsetter for hver levende bille. I tillegg til to foreldrebagler har hver bille et antall egne barn, alle sammenhengende med linjer. Hvis det trekkes ut, danner linjene en livsvekt som er forbundet med relasjon.

Divergens

Noen ganger blir enkelte gruppemedlemmer skilt fra hovedgruppen ved å migrere til en annen region eller ved uforutsigbare naturlige hendelser som jordskjelv eller branner. Over tid utvikler den nylig isolerte gruppen biologiske egenskaper, fra fargeendringer til ulike typer lemmer, som gjør det mulig å overleve i det nye miljøet. Til slutt vil det være umulig for de to gruppene å reprodusere og de blir separate arter. Dette er representert på et fylogenetisk tre av en linje som starter en ny gren. Arten er avbildet for å ha stått ned fra en felles forfader, men de har utviklet seg til separate arter. Divergens representerer evolusjonelt mangfold.

Det store bildet

Hver linje av divergens begynner deretter en ny grunnleggende web med flere divergenslinjer. Hvis du skulle tegne alt ut og ta ut bildene av arten (dine biller), så ville det se ut som en gigantisk linje med linjer. Hvis du forestiller deg å zoome utover, ser linjene av divergens ut til å være grener med roten til treet som representerer den felles forfederen til alle arter som er representert i treet. Fylogenetiske trær kan skildre data fra nivået av forskjellige arter til nivået av hvert kromosom innenfor arten, avhengig av hvilken type forskning du utfører. Orienteringen av fylogenetiske trær varierer; roten trenger ikke å være bunnen. Linjens lengde spiller ingen rolle. Det som er viktig er knuten, eller divergenslinjen, som viser den siste fellesfaderen til arten. Fylogenetiske trær er en illustrasjon av historien eller stammen til en levende art som dokumenterer nedstigning fra en felles forfader. Den enkleste måten å forstå denne tilsynelatende overveldende data på et grunnleggende nivå er å ta en liten del av treet og undersøke det nøye. Ved å kutte sammen de små delene av treet, kan du opprette et mer komplett bilde av det biologiske mangfoldet som representeres av hele fylogenetisk treet og fordype din forståelse av hvordan den komplekse utviklingsprosessen fungerer.